统计误差与块平均
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知识文档·分子模拟·误差估计·MolSimulX
轨迹跑完、平均值也算出来了——写论文还差一样东西:这个数大概准到什么程度? 麻烦在于:MD 相邻几帧几乎是同一副面孔。若把一千万帧都当成一千万个独立样本,误差条会小得离谱,那是假准。
正经做法只有两条路(常一起用):心里有个自相关时间 $\tau_A$,或更省事——做块平均(block averaging)。
本篇尽量讲清:帧数为什么不能当样本数、$\tau_A$ 怎么估个大概、块平均在干什么、以及「平均完再平均」会不会更糟。不必推随机过程;会画图、会切块、Methods 里写清估法就够。
先确认该不该开始统计,见 平衡判据与收敛;常见观测量见 轨迹分析与宏观性质。

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