非平衡分子动力学概述

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输运系数谱系 已把地图摊开：平衡用涨落（Einstein / Green–Kubo），非平衡用外加扰动直接测通量。本篇专讲后一条——非平衡分子动力学（NEMD）：怎么推、测什么、如何回到线性区，以及背后的 Onsager 线性不可逆热力学在说什么。

不重复「粘度对应哪条相关函数」——那张谱系仍在 输运系数谱系。本篇也不推完整不可逆过程热力学教材；抓住 力–通量–唯象系数 与模拟怎么对上号即可。文末略延伸强驱动下的非线性区，以及它和「耗散 / 不可逆热力学」怎么沾边（点到为止）。热浴策略见 常见系综与控温控压；盒子坑见 有限尺寸效应。

学习路径

前置阅读： 输运系数谱系 · 常见系综与控温控压 · 温度、压强与表面张力

下一步：

• 有限尺寸效应 —— 驱动几何与盒长
• 统计误差与块平均 —— 通量与外推的 ±
• 平衡判据与收敛 —— 驱动下定态与瞬态
• 统计力学基础与系综 —— 平衡系综与涨落的加深（与 GK 侧对照）
• 朗之万、布朗与溶剂介质方法 —— 摩擦耗散方程（勿与 NEMD 混淆）
• 粗粒化动力学加速与耗散 —— CG 流变、无量纲数与线性窗口