MDStudio粗粒颗粒

系列标签: MDStudio · 粗粒化 · CG · 对比单位

想跑一盒 LJ 溶剂、一根刚性棒、一片二维薄片,或一个空心球壳——这些体系没有 SMILES,也没法用 GAFF 去派原子类型:它们是由若干相同珠子摆出来的粗粒模型粗粒颗粒 Tab 直接按几何把珠子排好,同时写出配套的单类型 LJ 力场。

选维度 → 选几何 → 填尺寸与连接方式 → 预览 → 保存 {name}.mol + {name}.ff

产物可以直接进「搭建盒子」,不需要再走「力场生成」。默认全部使用对比单位(σ=ε=m=1),适合 LJ 教学体系、胶体 / 纳米颗粒模型与自定义 CG 模型的起手结构。粗粒化的概念背景见粗粒化与加速模型,对比单位见对比单位与无量纲化


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